Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ3

USP30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP30Q70CQ3 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
USP30Q70CQ3 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
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