| CTXN3 | Q4LDR2 | AC004223.1-201 | ENST00000479840 | 271 nt | BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SCARNA8-201 | ENST00000515924 | 131 nt | BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.666-201 | ENST00000516187 | 112 nt | BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNY3P16-201 | ENST00000516338 | 101 nt | BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-111P-201 | ENST00000517179 | 105 nt | BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL096861.1-201 | ENST00000610899 | 123 nt | BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | ZNF260-205 | ENST00000593142 | 4047 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | EVI2B-201 | ENST00000330927 | 1999 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.308-201 | ENST00000365043 | 101 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-381P-201 | ENST00000391259 | 108 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SNORD58.1-201 | ENST00000391313 | 66 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL606845.1-201 | ENST00000404881 | 255 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR548O-201 | ENST00000408583 | 114 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-955P-201 | ENST00000410497 | 104 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.622-201 | ENST00000411091 | 108 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC048334.1-201 | ENST00000477975 | 159 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC095059.1-201 | ENST00000502570 | 349 nt | TSL 5 BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SNORA31.2-201 | ENST00000516019 | 134 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU4-71P-201 | ENST00000516258 | 113 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-830P-201 | ENST00000516353 | 107 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU7-25P-201 | ENST00000516544 | 62 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU7-43P-201 | ENST00000516554 | 64 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC138625.2-201 | ENST00000563968 | 551 nt | TSL 3 BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR4764-201 | ENST00000580680 | 88 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL391903.3-201 | ENST00000612158 | 163 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC091895.1-201 | ENST00000624494 | 256 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | UBE3A-225 | ENST00000636667 | 5726 nt | TSL 5 BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR26B-201 | ENST00000362251 | 77 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNY3P5-201 | ENST00000384127 | 102 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SNORA40.6-201 | ENST00000391153 | 128 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | U8.17-201 | ENST00000391292 | 132 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-1299P-201 | ENST00000516316 | 100 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNA5SP61-201 | ENST00000516453 | 100 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-126P-201 | ENST00000516685 | 103 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR3660-201 | ENST00000584845 | 100 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR3192-201 | ENST00000584920 | 77 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | LINC01359-207 | ENST00000634799 | 487 nt | TSL 5 BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | JMJD1C-212 | ENST00000639129 | 7901 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNA5SP327-201 | ENST00000362494 | 101 nt | BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.199-201 | ENST00000364014 | 102 nt | BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SNORA25.9-201 | ENST00000365087 | 128 nt | BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-1228P-201 | ENST00000391014 | 107 nt | BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-493P-201 | ENST00000391321 | 108 nt | BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR1287-201 | ENST00000408492 | 90 nt | BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC092783.1-201 | ENST00000435832 | 231 nt | TSL 3 BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL121580.1-201 | ENST00000449941 | 219 nt | TSL 3 BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-365P-201 | ENST00000517113 | 106 nt | BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU7-181P-201 | ENST00000517234 | 74 nt | BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR548AR-201 | ENST00000582191 | 57 nt | BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | LINC01068-202 | ENST00000620874 | 626 nt | TSL 3 BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-923P-201 | ENST00000364753 | 107 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SNORA25.8-201 | ENST00000364831 | 128 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-53P-201 | ENST00000365367 | 106 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.401-201 | ENST00000383965 | 117 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.489-201 | ENST00000384410 | 101 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.547-201 | ENST00000384654 | 119 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SNORD28B-201 | ENST00000390993 | 75 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU2-70P-201 | ENST00000410718 | 179 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU2-55P-201 | ENST00000411146 | 174 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.626-201 | ENST00000411288 | 95 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-1054P-201 | ENST00000411293 | 104 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC245047.7-201 | ENST00000440265 | 293 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU7-41P-201 | ENST00000515917 | 61 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU4-57P-201 | ENST00000515980 | 135 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SNORA31.4-201 | ENST00000516049 | 129 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC019288.1-201 | ENST00000557918 | 224 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.432-201 | ENST00000384087 | 111 nt | BASIC | 1.35 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR499A-201 | ENST00000384903 | 122 nt | BASIC | 1.35 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SNORA26-201 | ENST00000391286 | 122 nt | BASIC | 1.35 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.618-201 | ENST00000410949 | 107 nt | BASIC | 1.35 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SNRPGP8-201 | ENST00000454064 | 226 nt | BASIC | 1.35 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC131956.1-201 | ENST00000506420 | 258 nt | TSL 2 BASIC | 1.35 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-693P-201 | ENST00000516134 | 107 nt | BASIC | 1.35 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SLC8A1-AS1-230 | ENST00000627538 | 212 nt | TSL 5 BASIC | 1.35 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | DEFB131A-201 | ENST00000334879 | 213 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.34 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-103P-201 | ENST00000363686 | 107 nt | BASIC | 1.34 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SNORD45.3-201 | ENST00000363836 | 72 nt | BASIC | 1.34 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.188-201 | ENST00000363952 | 111 nt | BASIC | 1.34 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SNORA1.2-201 | ENST00000365189 | 134 nt | BASIC | 1.34 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-484P-201 | ENST00000384016 | 107 nt | BASIC | 1.34 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR758-201 | ENST00000390227 | 88 nt | BASIC | 1.34 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-1270P-201 | ENST00000517128 | 108 nt | BASIC | 1.34 | □□□□□ -2.19 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.91-201 | ENST00000363042 | 107 nt | BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.634-201 | ENST00000364811 | 113 nt | BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-728P-201 | ENST00000365375 | 104 nt | BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.370-201 | ENST00000365589 | 108 nt | BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SNORD61-201 | ENST00000384252 | 73 nt | BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR570-201 | ENST00000384917 | 97 nt | BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR222-201 | ENST00000384992 | 110 nt | BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-910P-201 | ENST00000390844 | 107 nt | BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | snoU13.25-201 | ENST00000458945 | 104 nt | BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL133373.1-201 | ENST00000497098 | 94 nt | BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-561P-201 | ENST00000516222 | 102 nt | BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-504P-201 | ENST00000516568 | 104 nt | BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-1271P-201 | ENST00000517049 | 105 nt | BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SNORA70.22-201 | ENST00000517160 | 124 nt | BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC008133.2-201 | ENST00000624540 | 351 nt | BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | CEP57L1-213 | ENST00000520883 | 2055 nt | TSL 5 BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.7-201 | ENST00000362352 | 102 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SNORD115-28-201 | ENST00000363931 | 81 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |