Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
IMPG1Q17R60 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
IMPG1Q17R60 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
IMPG1Q17R60 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
IMPG1Q17R60 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
IMPG1Q17R60 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
IMPG1Q17R60 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
IMPG1Q17R60 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
IMPG1Q17R60 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
IMPG1Q17R60 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.9□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.9□□□□□ -2.55
IMPG1Q17R60 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC-0.91□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.6 ms