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Protein–RNA interactions for Protein: Q16143
SNCB, Beta-synuclein, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
SNCB
Q16143
RNU6-455P-201
ENST00000384681
107 nt
BASIC
-0.95
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
MIR548O-201
ENST00000408583
114 nt
BASIC
-0.95
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
RNU6-1203P-201
ENST00000410703
110 nt
BASIC
-0.95
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
MTND3P21-201
ENST00000433774
331 nt
BASIC
-0.95
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
RNU7-104P-201
ENST00000459398
79 nt
BASIC
-0.95
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
MIR5701-3-201
ENST00000578890
82 nt
BASIC
-0.95
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
MIR5701-1-201
ENST00000585138
82 nt
BASIC
-0.95
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
AC019193.3-201
ENST00000609144
554 nt
BASIC
-0.95
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
MIR5701-2-201
ENST00000615634
82 nt
BASIC
-0.95
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
Y_RNA.1-201
ENST00000352915
104 nt
BASIC
-0.96
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
Y_RNA.242-201
ENST00000364473
110 nt
BASIC
-0.96
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
RNU6-47P-201
ENST00000383866
107 nt
BASIC
-0.96
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
RNY1P7-201
ENST00000384743
110 nt
BASIC
-0.96
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
MIR604-201
ENST00000384880
94 nt
BASIC
-0.96
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
SNORA40.5-201
ENST00000391061
128 nt
BASIC
-0.96
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
UBE2V1P7-201
ENST00000446395
340 nt
BASIC
-0.96
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
SNORD11.1-201
ENST00000459482
85 nt
BASIC
-0.96
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
RPS29P24-201
ENST00000486345
171 nt
BASIC
-0.96
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
AP003357.1-201
ENST00000604497
148 nt
BASIC
-0.96
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
JPX_2.1-201
ENST00000614161
69 nt
BASIC
-0.96
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
RNU6-553P-201
ENST00000364047
96 nt
BASIC
-0.97
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
Y_RNA.364-201
ENST00000365532
101 nt
BASIC
-0.97
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
RNU6-949P-201
ENST00000384040
107 nt
BASIC
-0.97
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
Y_RNA.552-201
ENST00000384665
112 nt
BASIC
-0.97
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
MIR620-201
ENST00000385232
95 nt
BASIC
-0.97
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
MIRLET7F2-201
ENST00000385277
83 nt
BASIC
-0.97
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
Z95118.1-201
ENST00000421372
247 nt
BASIC
-0.97
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
AF228730.4-201
ENST00000421457
183 nt
BASIC
-0.97
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
MTND3P16-201
ENST00000452205
344 nt
BASIC
-0.97
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
RNU7-53P-201
ENST00000516705
60 nt
BASIC
-0.97
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
RNU6-881P-201
ENST00000516813
102 nt
BASIC
-0.97
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
AC018462.2-201
ENST00000605375
395 nt
BASIC
-0.97
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
MIR6717-201
ENST00000622747
73 nt
BASIC
-0.97
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
AC079248.2-201
ENST00000623779
326 nt
BASIC
-0.97
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
Y_RNA.372-201
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102 nt
BASIC
-0.98
□□□□□ -2.57
SNCB
Q16143
MIR539-201
ENST00000365690
78 nt
BASIC
-0.98
□□□□□ -2.57
SNCB
Q16143
SNORA27-201
ENST00000384323
126 nt
BASIC
-0.98
□□□□□ -2.57
SNCB
Q16143
RNY3P10-201
ENST00000384764
102 nt
BASIC
-0.98
□□□□□ -2.57
SNCB
Q16143
TRAJ1-201
ENST00000390536
62 nt
APPRIS P1
BASIC
-0.98
□□□□□ -2.57
SNCB
Q16143
MIR548I3-201
ENST00000408378
149 nt
BASIC
-0.98
□□□□□ -2.57
SNCB
Q16143
RNU4-55P-201
ENST00000410731
137 nt
BASIC
-0.98
□□□□□ -2.57
SNCB
Q16143
MTATP6P17-201
ENST00000431030
672 nt
BASIC
-0.98
□□□□□ -2.57
SNCB
Q16143
RNU6-531P-201
ENST00000516694
104 nt
BASIC
-0.98
□□□□□ -2.57
SNCB
Q16143
RNU7-116P-201
ENST00000516940
62 nt
BASIC
-0.98
□□□□□ -2.57
SNCB
Q16143
AC127455.1-201
ENST00000565496
145 nt
BASIC
-0.98
□□□□□ -2.57
SNCB
Q16143
MIR4636-201
ENST00000582271
80 nt
BASIC
-0.98
□□□□□ -2.57
SNCB
Q16143
AL356055.1-201
ENST00000602528
446 nt
BASIC
-0.98
□□□□□ -2.57
SNCB
Q16143
RNU6-86P-201
ENST00000606534
107 nt
BASIC
-0.98
□□□□□ -2.57
SNCB
Q16143
Y_RNA.135-201
ENST00000363439
95 nt
BASIC
-0.99
□□□□□ -2.57
SNCB
Q16143
RNU6-1201P-201
ENST00000384227
107 nt
BASIC
-0.99
□□□□□ -2.57
SNCB
Q16143
RNU6-831P-201
ENST00000384548
107 nt
BASIC
-0.99
□□□□□ -2.57
SNCB
Q16143
MIR548A2-201
ENST00000384956
97 nt
BASIC
-0.99
□□□□□ -2.57
SNCB
Q16143
RNU6-721P-201
ENST00000410155
105 nt
BASIC
-0.99
□□□□□ -2.57
SNCB
Q16143
RNU4-63P-201
ENST00000411313
118 nt
BASIC
-0.99
□□□□□ -2.57
SNCB
Q16143
AL500527.2-201
ENST00000454105
95 nt
BASIC
-0.99
□□□□□ -2.57
SNCB
Q16143
RNU7-45P-201
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63 nt
BASIC
-0.99
□□□□□ -2.57
SNCB
Q16143
RNU6-261P-201
ENST00000459506
102 nt
BASIC
-0.99
□□□□□ -2.57
SNCB
Q16143
AC083904.1-201
ENST00000487828
231 nt
BASIC
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□□□□□ -2.57
SNCB
Q16143
RNU7-115P-201
ENST00000516433
55 nt
BASIC
-0.99
□□□□□ -2.57
SNCB
Q16143
SNORD36C-201
ENST00000516733
66 nt
BASIC
-0.99
□□□□□ -2.57
SNCB
Q16143
NKAIN2-205
ENST00000546092
148 nt
TSL 5
BASIC
-0.99
□□□□□ -2.57
SNCB
Q16143
Y_RNA.38-201
ENST00000362617
102 nt
BASIC
-1
□□□□□ -2.57
SNCB
Q16143
Y_RNA.146-201
ENST00000363549
102 nt
BASIC
-1
□□□□□ -2.57
SNCB
Q16143
RNU4-36P-201
ENST00000364294
144 nt
BASIC
-1
□□□□□ -2.57
SNCB
Q16143
RNU6-879P-201
ENST00000364328
108 nt
BASIC
-1
□□□□□ -2.57
SNCB
Q16143
RNU6-1336P-201
ENST00000383886
109 nt
BASIC
-1
□□□□□ -2.57
SNCB
Q16143
Y_RNA.587-201
ENST00000391210
103 nt
BASIC
-1
□□□□□ -2.57
SNCB
Q16143
MIR190B-201
ENST00000401119
79 nt
BASIC
-1
□□□□□ -2.57
SNCB
Q16143
AL603914.1-201
ENST00000401964
204 nt
BASIC
-1
□□□□□ -2.57
SNCB
Q16143
AC023051.1-201
ENST00000414098
876 nt
TSL 5
BASIC
-1
□□□□□ -2.57
SNCB
Q16143
LINC02541-201
ENST00000427157
327 nt
TSL 3
BASIC
-1
□□□□□ -2.57
SNCB
Q16143
FCF1P4-201
ENST00000448326
183 nt
BASIC
-1
□□□□□ -2.57
SNCB
Q16143
RNU6-408P-201
ENST00000515910
100 nt
BASIC
-1
□□□□□ -2.57
SNCB
Q16143
RNU6-1194P-201
ENST00000516208
104 nt
BASIC
-1
□□□□□ -2.57
SNCB
Q16143
SNORD38.3-201
ENST00000516599
73 nt
BASIC
-1
□□□□□ -2.57
SNCB
Q16143
AC011373.1-201
ENST00000607270
237 nt
BASIC
-1
□□□□□ -2.57
SNCB
Q16143
MIR6851-201
ENST00000617060
67 nt
BASIC
-1
□□□□□ -2.57
SNCB
Q16143
Y_RNA.37-201
ENST00000362606
108 nt
BASIC
-1.01
□□□□□ -2.57
SNCB
Q16143
RNU6-653P-201
ENST00000363074
106 nt
BASIC
-1.01
□□□□□ -2.57
SNCB
Q16143
RNU4-73P-201
ENST00000363164
141 nt
BASIC
-1.01
□□□□□ -2.57
SNCB
Q16143
MIR181B2-201
ENST00000385004
89 nt
BASIC
-1.01
□□□□□ -2.57
SNCB
Q16143
AC063965.1-201
ENST00000416679
499 nt
TSL 3
BASIC
-1.01
□□□□□ -2.57
SNCB
Q16143
MTND1P14-201
ENST00000427400
950 nt
BASIC
-1.01
□□□□□ -2.57
SNCB
Q16143
AL158210.1-201
ENST00000448835
500 nt
TSL 3
BASIC
-1.01
□□□□□ -2.57
SNCB
Q16143
AC004930.1-201
ENST00000470677
254 nt
TSL 2
BASIC
-1.01
□□□□□ -2.57
SNCB
Q16143
AC083798.1-201
ENST00000472671
131 nt
BASIC
-1.01
□□□□□ -2.57
SNCB
Q16143
RNU6-998P-201
ENST00000515894
101 nt
BASIC
-1.01
□□□□□ -2.57
SNCB
Q16143
SCARNA17-201
ENST00000516183
144 nt
BASIC
-1.01
□□□□□ -2.57
SNCB
Q16143
RNU6-758P-201
ENST00000516292
89 nt
BASIC
-1.01
□□□□□ -2.57
SNCB
Q16143
RNU6-232P-201
ENST00000517144
64 nt
BASIC
-1.01
□□□□□ -2.57
SNCB
Q16143
AC138625.1-201
ENST00000567556
483 nt
TSL 3
BASIC
-1.01
□□□□□ -2.57
SNCB
Q16143
MIR4423-201
ENST00000580922
80 nt
BASIC
-1.01
□□□□□ -2.57
SNCB
Q16143
MIR4273-201
ENST00000582824
84 nt
BASIC
-1.01
□□□□□ -2.57
SNCB
Q16143
AF246928.1-201
ENST00000623768
87 nt
BASIC
-1.01
□□□□□ -2.57
SNCB
Q16143
AC007494.3-201
ENST00000624660
743 nt
BASIC
-1.01
□□□□□ -2.57
SNCB
Q16143
Y_RNA.48-201
ENST00000362710
103 nt
BASIC
-1.02
□□□□□ -2.57
SNCB
Q16143
RNU6-1301P-201
ENST00000362724
104 nt
BASIC
-1.02
□□□□□ -2.57
SNCB
Q16143
RNU6-1059P-201
ENST00000363752
98 nt
BASIC
-1.02
□□□□□ -2.57
SNCB
Q16143
SNORD115-28-201
ENST00000363931
81 nt
BASIC
-1.02
□□□□□ -2.57
SNCB
Q16143
RNY1P13-201
ENST00000365030
105 nt
BASIC
-1.02
□□□□□ -2.57
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