Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
VPS72Q15906 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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