Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SMCO1Q147U7 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SMCO1Q147U7 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SMCO1Q147U7 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SMCO1Q147U7 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SMCO1Q147U7 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC-1.73□□□□□ -2.69
SMCO1Q147U7 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SMCO1Q147U7 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SMCO1Q147U7 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SMCO1Q147U7 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SMCO1Q147U7 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SMCO1Q147U7 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SMCO1Q147U7 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SMCO1Q147U7 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SMCO1Q147U7 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SMCO1Q147U7 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC-1.74□□□□□ -2.69
SMCO1Q147U7 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SMCO1Q147U7 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SMCO1Q147U7 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SMCO1Q147U7 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SMCO1Q147U7 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SMCO1Q147U7 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SMCO1Q147U7 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-1.75□□□□□ -2.69
SMCO1Q147U7 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.75□□□□□ -2.69
SMCO1Q147U7 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SMCO1Q147U7 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SMCO1Q147U7 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SMCO1Q147U7 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SMCO1Q147U7 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SMCO1Q147U7 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SMCO1Q147U7 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SMCO1Q147U7 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SMCO1Q147U7 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SMCO1Q147U7 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SMCO1Q147U7 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SMCO1Q147U7 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC-1.76□□□□□ -2.69
SMCO1Q147U7 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SMCO1Q147U7 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SMCO1Q147U7 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SMCO1Q147U7 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SMCO1Q147U7 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SMCO1Q147U7 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SMCO1Q147U7 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SMCO1Q147U7 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SMCO1Q147U7 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SMCO1Q147U7 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SMCO1Q147U7 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SMCO1Q147U7 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SMCO1Q147U7 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SMCO1Q147U7 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SMCO1Q147U7 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SMCO1Q147U7 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC-1.77□□□□□ -2.69
SMCO1Q147U7 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SMCO1Q147U7 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
SMCO1Q147U7 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
SMCO1Q147U7 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
SMCO1Q147U7 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
SMCO1Q147U7 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
SMCO1Q147U7 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC-1.79□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC-1.8□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC-1.8□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC-1.8□□□□□ -2.7
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