Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NEDD9Q14511 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NEDD9Q14511 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NEDD9Q14511 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NEDD9Q14511 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NEDD9Q14511 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NEDD9Q14511 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NEDD9Q14511 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NEDD9Q14511 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NEDD9Q14511 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
NEDD9Q14511 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
NEDD9Q14511 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NEDD9Q14511 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NEDD9Q14511 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NEDD9Q14511 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NEDD9Q14511 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NEDD9Q14511 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NEDD9Q14511 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NEDD9Q14511 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NEDD9Q14511 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NEDD9Q14511 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NEDD9Q14511 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NEDD9Q14511 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
NEDD9Q14511 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NEDD9Q14511 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NEDD9Q14511 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NEDD9Q14511 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NEDD9Q14511 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NEDD9Q14511 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NEDD9Q14511 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NEDD9Q14511 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NEDD9Q14511 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NEDD9Q14511 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
NEDD9Q14511 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
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