Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PEX6Q13608 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PEX6Q13608 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PEX6Q13608 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.33□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PEX6Q13608 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms