Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC3.1□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
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