Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SP140Q13342 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SP140Q13342 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SP140Q13342 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SP140Q13342 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SP140Q13342 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SP140Q13342 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SP140Q13342 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SP140Q13342 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SP140Q13342 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SP140Q13342 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SP140Q13342 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SP140Q13342 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
SP140Q13342 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
SP140Q13342 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SP140Q13342 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SP140Q13342 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SP140Q13342 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SP140Q13342 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SP140Q13342 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SP140Q13342 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SP140Q13342 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SP140Q13342 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SP140Q13342 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SP140Q13342 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SP140Q13342 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SP140Q13342 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
SP140Q13342 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
SP140Q13342 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SP140Q13342 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SP140Q13342 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SP140Q13342 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SP140Q13342 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
SP140Q13342 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SP140Q13342 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SP140Q13342 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SP140Q13342 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SP140Q13342 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SP140Q13342 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SP140Q13342 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SP140Q13342 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SP140Q13342 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SP140Q13342 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SP140Q13342 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SP140Q13342 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SP140Q13342 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SP140Q13342 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SP140Q13342 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SP140Q13342 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SP140Q13342 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SP140Q13342 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SP140Q13342 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SP140Q13342 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SP140Q13342 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SP140Q13342 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SP140Q13342 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SP140Q13342 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SP140Q13342 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SP140Q13342 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SP140Q13342 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SP140Q13342 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SP140Q13342 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SP140Q13342 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SP140Q13342 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SP140Q13342 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SP140Q13342 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SP140Q13342 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SP140Q13342 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SP140Q13342 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SP140Q13342 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SP140Q13342 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SP140Q13342 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SP140Q13342 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SP140Q13342 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SP140Q13342 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SP140Q13342 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SP140Q13342 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SP140Q13342 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SP140Q13342 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SP140Q13342 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SP140Q13342 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SP140Q13342 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SP140Q13342 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SP140Q13342 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SP140Q13342 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
SP140Q13342 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SP140Q13342 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SP140Q13342 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SP140Q13342 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SP140Q13342 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SP140Q13342 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SP140Q13342 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SP140Q13342 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SP140Q13342 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SP140Q13342 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SP140Q13342 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SP140Q13342 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SP140Q13342 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SP140Q13342 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SP140Q13342 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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