Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DUSP4Q13115 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DUSP4Q13115 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DUSP4Q13115 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DUSP4Q13115 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DUSP4Q13115 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
DUSP4Q13115 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
DUSP4Q13115 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DUSP4Q13115 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DUSP4Q13115 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DUSP4Q13115 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DUSP4Q13115 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
DUSP4Q13115 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
DUSP4Q13115 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DUSP4Q13115 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DUSP4Q13115 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DUSP4Q13115 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DUSP4Q13115 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DUSP4Q13115 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DUSP4Q13115 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DUSP4Q13115 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DUSP4Q13115 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DUSP4Q13115 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DUSP4Q13115 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DUSP4Q13115 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DUSP4Q13115 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DUSP4Q13115 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
DUSP4Q13115 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
DUSP4Q13115 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DUSP4Q13115 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
DUSP4Q13115 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
DUSP4Q13115 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
DUSP4Q13115 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DUSP4Q13115 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DUSP4Q13115 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DUSP4Q13115 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DUSP4Q13115 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DUSP4Q13115 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
DUSP4Q13115 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
DUSP4Q13115 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
DUSP4Q13115 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
DUSP4Q13115 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DUSP4Q13115 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DUSP4Q13115 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DUSP4Q13115 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DUSP4Q13115 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DUSP4Q13115 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DUSP4Q13115 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DUSP4Q13115 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DUSP4Q13115 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
DUSP4Q13115 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
DUSP4Q13115 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
DUSP4Q13115 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
DUSP4Q13115 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
DUSP4Q13115 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
DUSP4Q13115 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
DUSP4Q13115 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
DUSP4Q13115 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
DUSP4Q13115 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
DUSP4Q13115 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
DUSP4Q13115 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
DUSP4Q13115 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
DUSP4Q13115 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
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