Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.77
MKRN3Q13064 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.77
MKRN3Q13064 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
MKRN3Q13064 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
MKRN3Q13064 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
MKRN3Q13064 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
MKRN3Q13064 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
MKRN3Q13064 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
MKRN3Q13064 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
MKRN3Q13064 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
MKRN3Q13064 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
MKRN3Q13064 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
MKRN3Q13064 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
MKRN3Q13064 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
MKRN3Q13064 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
MKRN3Q13064 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
MKRN3Q13064 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
MKRN3Q13064 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
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