Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC0.94□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CKAP4Q07065 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
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