Protein–RNA interactions for Protein: P53611

RABGGTB, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTBP53611 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RABGGTBP53611 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
RABGGTBP53611 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
RABGGTBP53611 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
RABGGTBP53611 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RABGGTBP53611 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RABGGTBP53611 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RABGGTBP53611 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RABGGTBP53611 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RABGGTBP53611 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RABGGTBP53611 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
RABGGTBP53611 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
RABGGTBP53611 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
RABGGTBP53611 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RABGGTBP53611 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RABGGTBP53611 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RABGGTBP53611 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RABGGTBP53611 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RABGGTBP53611 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RABGGTBP53611 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RABGGTBP53611 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RABGGTBP53611 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RABGGTBP53611 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RABGGTBP53611 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RABGGTBP53611 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RABGGTBP53611 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RABGGTBP53611 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
RABGGTBP53611 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
RABGGTBP53611 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RABGGTBP53611 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
RABGGTBP53611 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RABGGTBP53611 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RABGGTBP53611 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RABGGTBP53611 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RABGGTBP53611 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RABGGTBP53611 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RABGGTBP53611 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RABGGTBP53611 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RABGGTBP53611 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RABGGTBP53611 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RABGGTBP53611 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RABGGTBP53611 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RABGGTBP53611 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RABGGTBP53611 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RABGGTBP53611 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RABGGTBP53611 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RABGGTBP53611 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RABGGTBP53611 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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