Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC-0.72□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
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PTPRDP23468 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
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PTPRDP23468 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
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PTPRDP23468 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
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PTPRDP23468 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
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PTPRDP23468 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
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