Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
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