Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TPRNQ4KMQ1 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TPRNQ4KMQ1 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TPRNQ4KMQ1 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TPRNQ4KMQ1 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TPRNQ4KMQ1 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TPRNQ4KMQ1 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TPRNQ4KMQ1 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TPRNQ4KMQ1 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TPRNQ4KMQ1 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TPRNQ4KMQ1 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TPRNQ4KMQ1 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TPRNQ4KMQ1 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TPRNQ4KMQ1 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TPRNQ4KMQ1 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TPRNQ4KMQ1 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TPRNQ4KMQ1 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TPRNQ4KMQ1 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TPRNQ4KMQ1 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TPRNQ4KMQ1 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TPRNQ4KMQ1 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TPRNQ4KMQ1 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TPRNQ4KMQ1 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TPRNQ4KMQ1 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TPRNQ4KMQ1 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TPRNQ4KMQ1 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TPRNQ4KMQ1 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TPRNQ4KMQ1 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TPRNQ4KMQ1 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TPRNQ4KMQ1 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TPRNQ4KMQ1 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TPRNQ4KMQ1 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
TPRNQ4KMQ1 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TPRNQ4KMQ1 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TPRNQ4KMQ1 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TPRNQ4KMQ1 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TPRNQ4KMQ1 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TPRNQ4KMQ1 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TPRNQ4KMQ1 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TPRNQ4KMQ1 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
TPRNQ4KMQ1 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TPRNQ4KMQ1 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TPRNQ4KMQ1 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TPRNQ4KMQ1 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TPRNQ4KMQ1 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TPRNQ4KMQ1 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TPRNQ4KMQ1 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TPRNQ4KMQ1 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TPRNQ4KMQ1 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TPRNQ4KMQ1 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TPRNQ4KMQ1 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TPRNQ4KMQ1 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
TPRNQ4KMQ1 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TPRNQ4KMQ1 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TPRNQ4KMQ1 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TPRNQ4KMQ1 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TPRNQ4KMQ1 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TPRNQ4KMQ1 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TPRNQ4KMQ1 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TPRNQ4KMQ1 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TPRNQ4KMQ1 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TPRNQ4KMQ1 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TPRNQ4KMQ1 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TPRNQ4KMQ1 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TPRNQ4KMQ1 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TPRNQ4KMQ1 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TPRNQ4KMQ1 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TPRNQ4KMQ1 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
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