Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SWI5Q1ZZU3 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SWI5Q1ZZU3 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SWI5Q1ZZU3 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SWI5Q1ZZU3 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SWI5Q1ZZU3 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SWI5Q1ZZU3 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SWI5Q1ZZU3 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SWI5Q1ZZU3 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SWI5Q1ZZU3 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SWI5Q1ZZU3 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SWI5Q1ZZU3 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SWI5Q1ZZU3 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SWI5Q1ZZU3 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SWI5Q1ZZU3 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SWI5Q1ZZU3 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SWI5Q1ZZU3 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SWI5Q1ZZU3 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SWI5Q1ZZU3 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SWI5Q1ZZU3 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SWI5Q1ZZU3 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SWI5Q1ZZU3 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SWI5Q1ZZU3 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SWI5Q1ZZU3 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SWI5Q1ZZU3 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SWI5Q1ZZU3 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SWI5Q1ZZU3 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SWI5Q1ZZU3 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SWI5Q1ZZU3 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SWI5Q1ZZU3 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SWI5Q1ZZU3 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SWI5Q1ZZU3 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SWI5Q1ZZU3 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SWI5Q1ZZU3 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SWI5Q1ZZU3 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SWI5Q1ZZU3 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SWI5Q1ZZU3 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SWI5Q1ZZU3 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SWI5Q1ZZU3 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SWI5Q1ZZU3 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SWI5Q1ZZU3 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SWI5Q1ZZU3 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SWI5Q1ZZU3 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SWI5Q1ZZU3 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SWI5Q1ZZU3 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SWI5Q1ZZU3 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SWI5Q1ZZU3 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SWI5Q1ZZU3 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SWI5Q1ZZU3 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SWI5Q1ZZU3 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SWI5Q1ZZU3 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SWI5Q1ZZU3 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SWI5Q1ZZU3 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SWI5Q1ZZU3 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SWI5Q1ZZU3 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SWI5Q1ZZU3 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SWI5Q1ZZU3 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SWI5Q1ZZU3 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SWI5Q1ZZU3 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SWI5Q1ZZU3 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.9 ms