Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GEN1Q17RS7 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
GEN1Q17RS7 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
GEN1Q17RS7 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GEN1Q17RS7 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GEN1Q17RS7 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GEN1Q17RS7 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GEN1Q17RS7 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GEN1Q17RS7 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GEN1Q17RS7 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GEN1Q17RS7 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GEN1Q17RS7 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GEN1Q17RS7 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GEN1Q17RS7 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GEN1Q17RS7 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GEN1Q17RS7 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GEN1Q17RS7 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GEN1Q17RS7 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GEN1Q17RS7 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GEN1Q17RS7 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GEN1Q17RS7 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
GEN1Q17RS7 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GEN1Q17RS7 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GEN1Q17RS7 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GEN1Q17RS7 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GEN1Q17RS7 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GEN1Q17RS7 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GEN1Q17RS7 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GEN1Q17RS7 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
GEN1Q17RS7 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GEN1Q17RS7 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GEN1Q17RS7 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GEN1Q17RS7 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GEN1Q17RS7 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
GEN1Q17RS7 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
GEN1Q17RS7 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GEN1Q17RS7 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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