Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CTF1Q16619 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CTF1Q16619 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CTF1Q16619 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CTF1Q16619 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
CTF1Q16619 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CTF1Q16619 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
CTF1Q16619 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CTF1Q16619 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CTF1Q16619 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CTF1Q16619 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CTF1Q16619 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CTF1Q16619 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CTF1Q16619 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CTF1Q16619 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CTF1Q16619 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CTF1Q16619 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CTF1Q16619 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CTF1Q16619 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CTF1Q16619 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CTF1Q16619 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CTF1Q16619 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CTF1Q16619 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CTF1Q16619 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CTF1Q16619 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CTF1Q16619 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CTF1Q16619 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CTF1Q16619 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CTF1Q16619 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CTF1Q16619 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CTF1Q16619 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CTF1Q16619 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CTF1Q16619 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CTF1Q16619 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CTF1Q16619 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CTF1Q16619 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CTF1Q16619 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CTF1Q16619 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CTF1Q16619 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CTF1Q16619 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CTF1Q16619 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CTF1Q16619 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CTF1Q16619 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CTF1Q16619 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CTF1Q16619 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CTF1Q16619 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CTF1Q16619 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CTF1Q16619 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CTF1Q16619 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CTF1Q16619 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CTF1Q16619 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CTF1Q16619 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CTF1Q16619 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CTF1Q16619 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CTF1Q16619 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CTF1Q16619 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.2
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CTF1Q16619 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
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CTF1Q16619 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
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CTF1Q16619 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CTF1Q16619 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
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