Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ECM1Q16610 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ECM1Q16610 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ECM1Q16610 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ECM1Q16610 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ECM1Q16610 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ECM1Q16610 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ECM1Q16610 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ECM1Q16610 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ECM1Q16610 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ECM1Q16610 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ECM1Q16610 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ECM1Q16610 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ECM1Q16610 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ECM1Q16610 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ECM1Q16610 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ECM1Q16610 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ECM1Q16610 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ECM1Q16610 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ECM1Q16610 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ECM1Q16610 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ECM1Q16610 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ECM1Q16610 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ECM1Q16610 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ECM1Q16610 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ECM1Q16610 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ECM1Q16610 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ECM1Q16610 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ECM1Q16610 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ECM1Q16610 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ECM1Q16610 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ECM1Q16610 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ECM1Q16610 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
ECM1Q16610 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ECM1Q16610 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 191.3 ms