Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NTRK3Q16288 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
NTRK3Q16288 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NTRK3Q16288 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NTRK3Q16288 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NTRK3Q16288 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NTRK3Q16288 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NTRK3Q16288 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NTRK3Q16288 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
NTRK3Q16288 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NTRK3Q16288 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NTRK3Q16288 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NTRK3Q16288 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NTRK3Q16288 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NTRK3Q16288 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NTRK3Q16288 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NTRK3Q16288 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NTRK3Q16288 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NTRK3Q16288 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NTRK3Q16288 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NTRK3Q16288 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NTRK3Q16288 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NTRK3Q16288 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NTRK3Q16288 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NTRK3Q16288 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NTRK3Q16288 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NTRK3Q16288 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NTRK3Q16288 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
NTRK3Q16288 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NTRK3Q16288 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NTRK3Q16288 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NTRK3Q16288 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NTRK3Q16288 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NTRK3Q16288 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NTRK3Q16288 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NTRK3Q16288 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NTRK3Q16288 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NTRK3Q16288 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NTRK3Q16288 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NTRK3Q16288 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NTRK3Q16288 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NTRK3Q16288 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
NTRK3Q16288 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NTRK3Q16288 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NTRK3Q16288 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NTRK3Q16288 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NTRK3Q16288 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NTRK3Q16288 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NTRK3Q16288 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NTRK3Q16288 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NTRK3Q16288 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NTRK3Q16288 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NTRK3Q16288 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NTRK3Q16288 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NTRK3Q16288 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NTRK3Q16288 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NTRK3Q16288 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NTRK3Q16288 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NTRK3Q16288 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NTRK3Q16288 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NTRK3Q16288 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NTRK3Q16288 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NTRK3Q16288 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NTRK3Q16288 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NTRK3Q16288 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NTRK3Q16288 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NTRK3Q16288 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
NTRK3Q16288 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NTRK3Q16288 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NTRK3Q16288 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NTRK3Q16288 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NTRK3Q16288 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NTRK3Q16288 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NTRK3Q16288 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NTRK3Q16288 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
NTRK3Q16288 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NTRK3Q16288 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NTRK3Q16288 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NTRK3Q16288 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NTRK3Q16288 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NTRK3Q16288 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
NTRK3Q16288 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NTRK3Q16288 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
NTRK3Q16288 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NTRK3Q16288 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NTRK3Q16288 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NTRK3Q16288 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NTRK3Q16288 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NTRK3Q16288 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NTRK3Q16288 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NTRK3Q16288 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NTRK3Q16288 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NTRK3Q16288 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NTRK3Q16288 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NTRK3Q16288 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NTRK3Q16288 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NTRK3Q16288 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
NTRK3Q16288 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NTRK3Q16288 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NTRK3Q16288 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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