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Protein–RNA interactions for Protein: Q16143
SNCB, Beta-synuclein, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
SNCB
Q16143
SNORD115-1-201
ENST00000364961
82 nt
BASIC
-0.88
□□□□□ -2.55
SNCB
Q16143
SNORD115-26-201
ENST00000365067
82 nt
BASIC
-0.88
□□□□□ -2.55
SNCB
Q16143
SNORD115-10-201
ENST00000365073
81 nt
BASIC
-0.88
□□□□□ -2.55
SNCB
Q16143
SNORD115-43-201
ENST00000365503
82 nt
BASIC
-0.88
□□□□□ -2.55
SNCB
Q16143
SNORD115-36-201
ENST00000365629
82 nt
BASIC
-0.88
□□□□□ -2.55
SNCB
Q16143
RNU6-1310P-201
ENST00000384153
107 nt
BASIC
-0.88
□□□□□ -2.55
SNCB
Q16143
RNU6-318P-201
ENST00000384283
103 nt
BASIC
-0.88
□□□□□ -2.55
SNCB
Q16143
RNU6-95P-201
ENST00000384697
107 nt
BASIC
-0.88
□□□□□ -2.55
SNCB
Q16143
MIR516B1-201
ENST00000385211
90 nt
BASIC
-0.88
□□□□□ -2.55
SNCB
Q16143
USP9YP30-201
ENST00000430729
455 nt
BASIC
-0.88
□□□□□ -2.55
SNCB
Q16143
RNU6-966P-201
ENST00000516479
104 nt
BASIC
-0.88
□□□□□ -2.55
SNCB
Q16143
Y_RNA.697-201
ENST00000516776
113 nt
BASIC
-0.88
□□□□□ -2.55
SNCB
Q16143
SNORD115-40-201
ENST00000606510
82 nt
BASIC
-0.88
□□□□□ -2.55
SNCB
Q16143
AL662814.1-201
ENST00000617364
121 nt
BASIC
-0.88
□□□□□ -2.55
SNCB
Q16143
DEFB131A-201
ENST00000334879
213 nt
APPRIS P1
TSL 1 (best)
BASIC
-0.89
□□□□□ -2.55
SNCB
Q16143
Y_RNA.49-201
ENST00000362714
112 nt
BASIC
-0.89
□□□□□ -2.55
SNCB
Q16143
Y_RNA.203-201
ENST00000364106
102 nt
BASIC
-0.89
□□□□□ -2.55
SNCB
Q16143
Y_RNA.358-201
ENST00000365491
99 nt
BASIC
-0.89
□□□□□ -2.55
SNCB
Q16143
RNU6-1103P-201
ENST00000384150
107 nt
BASIC
-0.89
□□□□□ -2.55
SNCB
Q16143
MIR517A-201
ENST00000385001
87 nt
BASIC
-0.89
□□□□□ -2.55
SNCB
Q16143
CHEK2P4-201
ENST00000450340
246 nt
BASIC
-0.89
□□□□□ -2.55
SNCB
Q16143
Y_RNA.681-201
ENST00000516445
113 nt
BASIC
-0.89
□□□□□ -2.55
SNCB
Q16143
Y_RNA.706-201
ENST00000516933
99 nt
BASIC
-0.89
□□□□□ -2.55
SNCB
Q16143
MTCO2P4-201
ENST00000517968
247 nt
BASIC
-0.89
□□□□□ -2.55
SNCB
Q16143
AL360085.1-201
ENST00000604713
532 nt
BASIC
-0.89
□□□□□ -2.55
SNCB
Q16143
RNA5SP403-201
ENST00000363598
108 nt
BASIC
-0.9
□□□□□ -2.55
SNCB
Q16143
RNU6-1184P-201
ENST00000384588
108 nt
BASIC
-0.9
□□□□□ -2.55
SNCB
Q16143
Y_RNA.533-201
ENST00000384596
114 nt
BASIC
-0.9
□□□□□ -2.55
SNCB
Q16143
MIR514A2-201
ENST00000385131
88 nt
BASIC
-0.9
□□□□□ -2.55
SNCB
Q16143
MIR514A3-201
ENST00000385132
88 nt
BASIC
-0.9
□□□□□ -2.55
SNCB
Q16143
SNORA26.6-201
ENST00000391256
115 nt
BASIC
-0.9
□□□□□ -2.55
SNCB
Q16143
RNU6-1133P-201
ENST00000410963
100 nt
BASIC
-0.9
□□□□□ -2.55
SNCB
Q16143
MTATP6P13-201
ENST00000438531
667 nt
BASIC
-0.9
□□□□□ -2.55
SNCB
Q16143
RNA5SP401-201
ENST00000515920
127 nt
BASIC
-0.9
□□□□□ -2.55
SNCB
Q16143
SCARNA20.2-201
ENST00000516052
116 nt
BASIC
-0.9
□□□□□ -2.55
SNCB
Q16143
Y_RNA.692-201
ENST00000516627
105 nt
BASIC
-0.9
□□□□□ -2.55
SNCB
Q16143
AP003072.1-201
ENST00000531740
145 nt
BASIC
-0.9
□□□□□ -2.55
SNCB
Q16143
AC079466.2-201
ENST00000585394
185 nt
TSL 5
BASIC
-0.9
□□□□□ -2.55
SNCB
Q16143
AC105081.1-201
ENST00000617727
106 nt
BASIC
-0.9
□□□□□ -2.55
SNCB
Q16143
AC073869.9-201
ENST00000641610
120 nt
BASIC
-0.9
□□□□□ -2.55
SNCB
Q16143
RNU6-874P-201
ENST00000362390
105 nt
BASIC
-0.91
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
RNU6-490P-201
ENST00000362985
107 nt
BASIC
-0.91
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
Y_RNA.101-201
ENST00000363154
102 nt
BASIC
-0.91
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
RNU6-254P-201
ENST00000363377
107 nt
BASIC
-0.91
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
RNU6-702P-201
ENST00000364982
107 nt
BASIC
-0.91
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
RNU6-596P-201
ENST00000365395
98 nt
BASIC
-0.91
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
RNU6-1323P-201
ENST00000384025
107 nt
BASIC
-0.91
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
MIR9-2-201
ENST00000384838
87 nt
BASIC
-0.91
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
MTCO2P19-201
ENST00000427513
598 nt
BASIC
-0.91
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
AC244505.6-201
ENST00000452829
130 nt
BASIC
-0.91
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
RNA5SP484-201
ENST00000458857
111 nt
BASIC
-0.91
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
SNORA40.9-201
ENST00000515895
93 nt
BASIC
-0.91
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
AC027544.2-201
ENST00000539313
630 nt
TSL 5
BASIC
-0.91
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
OSBPL9P5-201
ENST00000542581
171 nt
BASIC
-0.91
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
MIR4802-201
ENST00000581881
80 nt
BASIC
-0.91
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
MIR4493-201
ENST00000584016
73 nt
BASIC
-0.91
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
Y_RNA.241-201
ENST00000364470
117 nt
BASIC
-0.92
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
SNORA72.3-201
ENST00000365074
132 nt
BASIC
-0.92
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
Y_RNA.381-201
ENST00000365666
102 nt
BASIC
-0.92
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
Y_RNA.560-201
ENST00000384689
102 nt
BASIC
-0.92
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
SNORD37.1-201
ENST00000390968
65 nt
BASIC
-0.92
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
SNORD110-201
ENST00000408189
75 nt
BASIC
-0.92
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
MIR1278-201
ENST00000408753
81 nt
BASIC
-0.92
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
RNU6-175P-201
ENST00000516896
107 nt
BASIC
-0.92
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
AC100801.1-202
ENST00000518266
371 nt
TSL 3
BASIC
-0.92
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
AL358937.1-201
ENST00000524512
336 nt
TSL 2
BASIC
-0.92
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
MIR3681-201
ENST00000580089
72 nt
BASIC
-0.92
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
MIR4280-201
ENST00000582178
76 nt
BASIC
-0.92
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
AC124312.5-201
ENST00000604451
268 nt
BASIC
-0.92
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
AC004467.1-201
ENST00000615678
330 nt
BASIC
-0.92
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
AC022960.3-201
ENST00000619794
441 nt
BASIC
-0.92
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
MTND5P32-201
ENST00000560711
1802 nt
BASIC
-0.92
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
Y_RNA.201-201
ENST00000364052
96 nt
BASIC
-0.93
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
RNU6-522P-201
ENST00000364497
107 nt
BASIC
-0.93
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
TRAJ57-201
ENST00000390482
63 nt
APPRIS P1
BASIC
-0.93
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
RNU6-192P-201
ENST00000391253
100 nt
BASIC
-0.93
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
AL353193.1-201
ENST00000421444
268 nt
BASIC
-0.93
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
SNORD11-201
ENST00000459124
84 nt
BASIC
-0.93
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
Y_RNA.637-201
ENST00000459424
114 nt
BASIC
-0.93
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
MTND3P7-201
ENST00000474435
343 nt
BASIC
-0.93
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
AC093726.3-201
ENST00000637588
150 nt
BASIC
-0.93
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
RNU4-50P-201
ENST00000364361
141 nt
BASIC
-0.94
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
SNORA72.6-201
ENST00000384520
129 nt
BASIC
-0.94
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
SNORD56B-201
ENST00000384713
71 nt
BASIC
-0.94
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
MIR196A1-201
ENST00000388006
70 nt
BASIC
-0.94
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
AC006210.1-201
ENST00000424882
111 nt
BASIC
-0.94
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
AL353742.1-201
ENST00000453455
224 nt
TSL 3
BASIC
-0.94
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
Y_RNA.648-201
ENST00000459455
110 nt
BASIC
-0.94
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
AC068658.1-201
ENST00000507509
388 nt
TSL 2
BASIC
-0.94
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
RNU6-1129P-201
ENST00000515964
104 nt
BASIC
-0.94
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
RNU6-436P-201
ENST00000516171
114 nt
BASIC
-0.94
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
RNU7-188P-201
ENST00000517063
64 nt
BASIC
-0.94
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
AC141846.1-201
ENST00000568348
142 nt
BASIC
-0.94
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
MIR5188-201
ENST00000583467
113 nt
BASIC
-0.94
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
AC124303.1-201
ENST00000605703
360 nt
BASIC
-0.94
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
Y_RNA.30-201
ENST00000362572
97 nt
BASIC
-0.95
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
RNU6-961P-201
ENST00000363893
105 nt
BASIC
-0.95
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
Y_RNA.310-201
ENST00000365063
113 nt
BASIC
-0.95
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
Y_RNA.450-201
ENST00000384198
113 nt
BASIC
-0.95
□□□□□ -2.56
SNCB
Q16143
Y_RNA.557-201
ENST00000384680
107 nt
BASIC
-0.95
□□□□□ -2.56
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