Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SKIV2LQ15477 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SKIV2LQ15477 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SKIV2LQ15477 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SKIV2LQ15477 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SKIV2LQ15477 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SKIV2LQ15477 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SKIV2LQ15477 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SKIV2LQ15477 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SKIV2LQ15477 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SKIV2LQ15477 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SKIV2LQ15477 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SKIV2LQ15477 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SKIV2LQ15477 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SKIV2LQ15477 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SKIV2LQ15477 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SKIV2LQ15477 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SKIV2LQ15477 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SKIV2LQ15477 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SKIV2LQ15477 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SKIV2LQ15477 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SKIV2LQ15477 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SKIV2LQ15477 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SKIV2LQ15477 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SKIV2LQ15477 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SKIV2LQ15477 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SKIV2LQ15477 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SKIV2LQ15477 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SKIV2LQ15477 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SKIV2LQ15477 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SKIV2LQ15477 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SKIV2LQ15477 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SKIV2LQ15477 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SKIV2LQ15477 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SKIV2LQ15477 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SKIV2LQ15477 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SKIV2LQ15477 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SKIV2LQ15477 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SKIV2LQ15477 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SKIV2LQ15477 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SKIV2LQ15477 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SKIV2LQ15477 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SKIV2LQ15477 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SKIV2LQ15477 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SKIV2LQ15477 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SKIV2LQ15477 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SKIV2LQ15477 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SKIV2LQ15477 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SKIV2LQ15477 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SKIV2LQ15477 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SKIV2LQ15477 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SKIV2LQ15477 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SKIV2LQ15477 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SKIV2LQ15477 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SKIV2LQ15477 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SKIV2LQ15477 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SKIV2LQ15477 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SKIV2LQ15477 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SKIV2LQ15477 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SKIV2LQ15477 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SKIV2LQ15477 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SKIV2LQ15477 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SKIV2LQ15477 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SKIV2LQ15477 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SKIV2LQ15477 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SKIV2LQ15477 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SKIV2LQ15477 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SKIV2LQ15477 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SKIV2LQ15477 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SKIV2LQ15477 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SKIV2LQ15477 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SKIV2LQ15477 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SKIV2LQ15477 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SKIV2LQ15477 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SKIV2LQ15477 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SKIV2LQ15477 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SKIV2LQ15477 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SKIV2LQ15477 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SKIV2LQ15477 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SKIV2LQ15477 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SKIV2LQ15477 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SKIV2LQ15477 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SKIV2LQ15477 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SKIV2LQ15477 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SKIV2LQ15477 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SKIV2LQ15477 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SKIV2LQ15477 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SKIV2LQ15477 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SKIV2LQ15477 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SKIV2LQ15477 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SKIV2LQ15477 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SKIV2LQ15477 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SKIV2LQ15477 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SKIV2LQ15477 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SKIV2LQ15477 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SKIV2LQ15477 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SKIV2LQ15477 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SKIV2LQ15477 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SKIV2LQ15477 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SKIV2LQ15477 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
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