Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SHHQ15465 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SHHQ15465 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SHHQ15465 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SHHQ15465 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SHHQ15465 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SHHQ15465 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SHHQ15465 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SHHQ15465 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SHHQ15465 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SHHQ15465 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SHHQ15465 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SHHQ15465 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SHHQ15465 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SHHQ15465 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SHHQ15465 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SHHQ15465 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SHHQ15465 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SHHQ15465 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SHHQ15465 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SHHQ15465 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SHHQ15465 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SHHQ15465 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SHHQ15465 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SHHQ15465 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SHHQ15465 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SHHQ15465 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SHHQ15465 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SHHQ15465 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SHHQ15465 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SHHQ15465 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SHHQ15465 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SHHQ15465 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SHHQ15465 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SHHQ15465 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SHHQ15465 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SHHQ15465 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SHHQ15465 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SHHQ15465 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SHHQ15465 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SHHQ15465 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SHHQ15465 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SHHQ15465 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SHHQ15465 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
SHHQ15465 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SHHQ15465 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
SHHQ15465 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
SHHQ15465 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SHHQ15465 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SHHQ15465 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SHHQ15465 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
SHHQ15465 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SHHQ15465 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SHHQ15465 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SHHQ15465 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SHHQ15465 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SHHQ15465 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SHHQ15465 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SHHQ15465 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SHHQ15465 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SHHQ15465 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SHHQ15465 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SHHQ15465 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SHHQ15465 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SHHQ15465 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SHHQ15465 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SHHQ15465 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SHHQ15465 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SHHQ15465 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SHHQ15465 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SHHQ15465 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SHHQ15465 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SHHQ15465 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SHHQ15465 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SHHQ15465 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SHHQ15465 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SHHQ15465 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SHHQ15465 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SHHQ15465 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SHHQ15465 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SHHQ15465 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SHHQ15465 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SHHQ15465 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SHHQ15465 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SHHQ15465 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SHHQ15465 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SHHQ15465 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SHHQ15465 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SHHQ15465 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SHHQ15465 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SHHQ15465 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SHHQ15465 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
SHHQ15465 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SHHQ15465 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
SHHQ15465 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SHHQ15465 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SHHQ15465 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SHHQ15465 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SHHQ15465 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SHHQ15465 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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