Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NFIXQ14938 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NFIXQ14938 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NFIXQ14938 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NFIXQ14938 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NFIXQ14938 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NFIXQ14938 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NFIXQ14938 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NFIXQ14938 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NFIXQ14938 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
NFIXQ14938 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
NFIXQ14938 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NFIXQ14938 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NFIXQ14938 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NFIXQ14938 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NFIXQ14938 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NFIXQ14938 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NFIXQ14938 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NFIXQ14938 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NFIXQ14938 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NFIXQ14938 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NFIXQ14938 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NFIXQ14938 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NFIXQ14938 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NFIXQ14938 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NFIXQ14938 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NFIXQ14938 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NFIXQ14938 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NFIXQ14938 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NFIXQ14938 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NFIXQ14938 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NFIXQ14938 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NFIXQ14938 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NFIXQ14938 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NFIXQ14938 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NFIXQ14938 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NFIXQ14938 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NFIXQ14938 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NFIXQ14938 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NFIXQ14938 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NFIXQ14938 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NFIXQ14938 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NFIXQ14938 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NFIXQ14938 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NFIXQ14938 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NFIXQ14938 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NFIXQ14938 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NFIXQ14938 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NFIXQ14938 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NFIXQ14938 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NFIXQ14938 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NFIXQ14938 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NFIXQ14938 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NFIXQ14938 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NFIXQ14938 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NFIXQ14938 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NFIXQ14938 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NFIXQ14938 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NFIXQ14938 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NFIXQ14938 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NFIXQ14938 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NFIXQ14938 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NFIXQ14938 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NFIXQ14938 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NFIXQ14938 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NFIXQ14938 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NFIXQ14938 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NFIXQ14938 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NFIXQ14938 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NFIXQ14938 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NFIXQ14938 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NFIXQ14938 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NFIXQ14938 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NFIXQ14938 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NFIXQ14938 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NFIXQ14938 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NFIXQ14938 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NFIXQ14938 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NFIXQ14938 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NFIXQ14938 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NFIXQ14938 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NFIXQ14938 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NFIXQ14938 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NFIXQ14938 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NFIXQ14938 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NFIXQ14938 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NFIXQ14938 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NFIXQ14938 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NFIXQ14938 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NFIXQ14938 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NFIXQ14938 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NFIXQ14938 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NFIXQ14938 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NFIXQ14938 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NFIXQ14938 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NFIXQ14938 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NFIXQ14938 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NFIXQ14938 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NFIXQ14938 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NFIXQ14938 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.1 ms