Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHD4Q14839 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHD4Q14839 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHD4Q14839 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHD4Q14839 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHD4Q14839 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHD4Q14839 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHD4Q14839 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHD4Q14839 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHD4Q14839 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHD4Q14839 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CHD4Q14839 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHD4Q14839 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHD4Q14839 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHD4Q14839 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHD4Q14839 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHD4Q14839 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHD4Q14839 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHD4Q14839 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHD4Q14839 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHD4Q14839 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHD4Q14839 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHD4Q14839 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHD4Q14839 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHD4Q14839 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHD4Q14839 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHD4Q14839 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHD4Q14839 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHD4Q14839 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHD4Q14839 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHD4Q14839 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHD4Q14839 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHD4Q14839 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
CHD4Q14839 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHD4Q14839 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
CHD4Q14839 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHD4Q14839 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHD4Q14839 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHD4Q14839 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHD4Q14839 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHD4Q14839 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHD4Q14839 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHD4Q14839 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHD4Q14839 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHD4Q14839 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHD4Q14839 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHD4Q14839 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHD4Q14839 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHD4Q14839 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
CHD4Q14839 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHD4Q14839 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHD4Q14839 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHD4Q14839 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHD4Q14839 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHD4Q14839 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHD4Q14839 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CHD4Q14839 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CHD4Q14839 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CHD4Q14839 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CHD4Q14839 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.96□□□□□ -2.26
CHD4Q14839 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
CHD4Q14839 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHD4Q14839 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHD4Q14839 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
CHD4Q14839 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHD4Q14839 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHD4Q14839 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHD4Q14839 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHD4Q14839 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
CHD4Q14839 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHD4Q14839 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHD4Q14839 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHD4Q14839 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHD4Q14839 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHD4Q14839 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHD4Q14839 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHD4Q14839 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHD4Q14839 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHD4Q14839 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHD4Q14839 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHD4Q14839 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHD4Q14839 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHD4Q14839 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHD4Q14839 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
CHD4Q14839 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHD4Q14839 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHD4Q14839 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHD4Q14839 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHD4Q14839 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHD4Q14839 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CHD4Q14839 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CHD4Q14839 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CHD4Q14839 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CHD4Q14839 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CHD4Q14839 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CHD4Q14839 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CHD4Q14839 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CHD4Q14839 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CHD4Q14839 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CHD4Q14839 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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