Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NEDD9Q14511 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
NEDD9Q14511 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NEDD9Q14511 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
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