Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC-1.34□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC-1.34□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC-1.35□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC-1.35□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC-1.35□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC-1.35□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.36□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.36□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
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COL4A6Q14031 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
COL4A6Q14031 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC-1.4□□□□□ -2.63
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