Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF2H3Q13889 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF2H3Q13889 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF2H3Q13889 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF2H3Q13889 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF2H3Q13889 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF2H3Q13889 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF2H3Q13889 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF2H3Q13889 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF2H3Q13889 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF2H3Q13889 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF2H3Q13889 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
GTF2H3Q13889 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF2H3Q13889 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF2H3Q13889 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF2H3Q13889 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF2H3Q13889 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF2H3Q13889 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF2H3Q13889 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF2H3Q13889 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF2H3Q13889 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF2H3Q13889 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF2H3Q13889 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF2H3Q13889 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF2H3Q13889 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
GTF2H3Q13889 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GTF2H3Q13889 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.1 ms