Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PKP1Q13835 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.1 ms