| NAE1 | Q13564 | SCARNA8-201 | ENST00000515924 | 131 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| NAE1 | Q13564 | GHRLOS.1-201 | ENST00000610995 | 70 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC006441.5-201 | ENST00000612680 | 209 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| NAE1 | Q13564 | MIR6715A-201 | ENST00000615929 | 79 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| NAE1 | Q13564 | AL353997.5-201 | ENST00000618886 | 171 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| NAE1 | Q13564 | AL161722.3-201 | ENST00000605789 | 2983 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| NAE1 | Q13564 | ZNF260-203 | ENST00000588993 | 4174 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| NAE1 | Q13564 | Y_RNA.188-201 | ENST00000363952 | 111 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU4-17P-201 | ENST00000365598 | 141 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| NAE1 | Q13564 | Y_RNA.489-201 | ENST00000384410 | 101 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| NAE1 | Q13564 | MIR616-201 | ENST00000385293 | 97 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| NAE1 | Q13564 | MT-TG-201 | ENST00000387429 | 68 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| NAE1 | Q13564 | MT-TT-201 | ENST00000387460 | 66 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| NAE1 | Q13564 | Y_RNA.626-201 | ENST00000411288 | 95 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| NAE1 | Q13564 | AL121580.1-201 | ENST00000449941 | 219 nt | TSL 3 BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNY3P16-201 | ENST00000516338 | 101 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| NAE1 | Q13564 | AL160236.1-201 | ENST00000556317 | 195 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| NAE1 | Q13564 | Pinc.1-201 | ENST00000616452 | 154 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| NAE1 | Q13564 | NPPA-AS1_2.1-201 | ENST00000618496 | 149 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| NAE1 | Q13564 | EVI2B-201 | ENST00000330927 | 1999 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| NAE1 | Q13564 | SNORD38C-201 | ENST00000384381 | 69 nt | BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
| NAE1 | Q13564 | TRAJ47-201 | ENST00000390490 | 57 nt | APPRIS P1 BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU6-453P-201 | ENST00000516819 | 85 nt | BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU6-1271P-201 | ENST00000517049 | 105 nt | BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
| NAE1 | Q13564 | MIR4662B-201 | ENST00000579498 | 81 nt | BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
| NAE1 | Q13564 | AL391903.3-201 | ENST00000612158 | 163 nt | BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
| NAE1 | Q13564 | CTDSPL2-202 | ENST00000558373 | 4255 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
| NAE1 | Q13564 | MT-ATP8-201 | ENST00000361851 | 207 nt | APPRIS P1 BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| NAE1 | Q13564 | U8.1-201 | ENST00000362843 | 134 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNA5SP99-201 | ENST00000364020 | 114 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| NAE1 | Q13564 | Y_RNA.308-201 | ENST00000365043 | 101 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNY3P5-201 | ENST00000384127 | 102 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| NAE1 | Q13564 | MIR15B-201 | ENST00000385045 | 98 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| NAE1 | Q13564 | RN7SKP164-201 | ENST00000516138 | 266 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU6-165P-201 | ENST00000517170 | 99 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC104984.5-201 | ENST00000586878 | 94 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| NAE1 | Q13564 | AL357312.1-201 | ENST00000603879 | 298 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| NAE1 | Q13564 | Y_RNA.486-201 | ENST00000384398 | 107 nt | BASIC | 1.35 | □□□□□ -2.19 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU6-1228P-201 | ENST00000391014 | 107 nt | BASIC | 1.35 | □□□□□ -2.19 | | |
| NAE1 | Q13564 | AL606845.1-201 | ENST00000404881 | 255 nt | BASIC | 1.35 | □□□□□ -2.19 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU6-830P-201 | ENST00000516353 | 107 nt | BASIC | 1.35 | □□□□□ -2.19 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNA5SP61-201 | ENST00000516453 | 100 nt | BASIC | 1.35 | □□□□□ -2.19 | | |
| NAE1 | Q13564 | SNORA74.3-201 | ENST00000517108 | 154 nt | BASIC | 1.35 | □□□□□ -2.19 | | |
| NAE1 | Q13564 | CYP3A52P-201 | ENST00000563326 | 91 nt | BASIC | 1.35 | □□□□□ -2.19 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC138625.2-201 | ENST00000563968 | 551 nt | TSL 3 BASIC | 1.35 | □□□□□ -2.19 | | |
| NAE1 | Q13564 | MIR4524B-201 | ENST00000581569 | 115 nt | BASIC | 1.35 | □□□□□ -2.19 | | |
| NAE1 | Q13564 | DEFB131A-201 | ENST00000334879 | 213 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.34 | □□□□□ -2.19 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU6-379P-201 | ENST00000363813 | 104 nt | BASIC | 1.34 | □□□□□ -2.19 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU4-62P-201 | ENST00000410125 | 130 nt | BASIC | 1.34 | □□□□□ -2.19 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU2-55P-201 | ENST00000411146 | 174 nt | BASIC | 1.34 | □□□□□ -2.19 | | |
| NAE1 | Q13564 | RPS29P23-201 | ENST00000458635 | 123 nt | BASIC | 1.34 | □□□□□ -2.19 | | |
| NAE1 | Q13564 | RN7SKP88-201 | ENST00000516847 | 250 nt | BASIC | 1.34 | □□□□□ -2.19 | | |
| NAE1 | Q13564 | SNORA18.7-201 | ENST00000516910 | 131 nt | BASIC | 1.34 | □□□□□ -2.19 | | |
| NAE1 | Q13564 | IGLVVI-22-1-201 | ENST00000521183 | 211 nt | BASIC | 1.34 | □□□□□ -2.19 | | |
| NAE1 | Q13564 | DNAJC19P9-201 | ENST00000555084 | 351 nt | BASIC | 1.34 | □□□□□ -2.19 | | |
| NAE1 | Q13564 | 7SK.8-201 | ENST00000612110 | 250 nt | BASIC | 1.34 | □□□□□ -2.19 | | |
| NAE1 | Q13564 | 7SK.11-201 | ENST00000615477 | 250 nt | BASIC | 1.34 | □□□□□ -2.19 | | |
| NAE1 | Q13564 | GNAS-AS1_4.1-201 | ENST00000616546 | 112 nt | BASIC | 1.34 | □□□□□ -2.19 | | |
| NAE1 | Q13564 | 7SK.13-201 | ENST00000622040 | 250 nt | BASIC | 1.34 | □□□□□ -2.19 | | |
| NAE1 | Q13564 | ZNF209P-201 | ENST00000593450 | 2304 nt | BASIC | 1.34 | □□□□□ -2.2 | | |
| NAE1 | Q13564 | NPAT-201 | ENST00000278612 | 6117 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| NAE1 | Q13564 | Y_RNA.199-201 | ENST00000364014 | 102 nt | BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU6-484P-201 | ENST00000384016 | 107 nt | BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU6-493P-201 | ENST00000391321 | 108 nt | BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| NAE1 | Q13564 | AL135923.1-201 | ENST00000413066 | 196 nt | TSL 3 BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| NAE1 | Q13564 | SNRPGP8-201 | ENST00000454064 | 226 nt | BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| NAE1 | Q13564 | SNORD123-201 | ENST00000459473 | 70 nt | BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| NAE1 | Q13564 | LINC02514-201 | ENST00000509058 | 498 nt | TSL 3 BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| NAE1 | Q13564 | Y_RNA.666-201 | ENST00000516187 | 112 nt | BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU6-126P-201 | ENST00000516685 | 103 nt | BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| NAE1 | Q13564 | DEFB131B-201 | ENST00000530210 | 213 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC009779.6-201 | ENST00000603972 | 165 nt | BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| NAE1 | Q13564 | Metazoa_SRP.32-201 | ENST00000622685 | 286 nt | BASIC | 1.33 | □□□□□ -2.2 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU6-103P-201 | ENST00000363686 | 107 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| NAE1 | Q13564 | Y_RNA.200-201 | ENST00000364018 | 102 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| NAE1 | Q13564 | Y_RNA.622-201 | ENST00000411091 | 108 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU6-1299P-201 | ENST00000516316 | 100 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| NAE1 | Q13564 | SNORD111.1-201 | ENST00000516421 | 86 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU1-92P-201 | ENST00000517017 | 135 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| NAE1 | Q13564 | MIR4308-201 | ENST00000580634 | 81 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| NAE1 | Q13564 | AP000942.4-201 | ENST00000604811 | 241 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC015726.2-201 | ENST00000620112 | 122 nt | BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| NAE1 | Q13564 | UBE3A-225 | ENST00000636667 | 5726 nt | TSL 5 BASIC | 1.32 | □□□□□ -2.2 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU6-923P-201 | ENST00000364753 | 107 nt | BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| NAE1 | Q13564 | Y_RNA.432-201 | ENST00000384087 | 111 nt | BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| NAE1 | Q13564 | Y_RNA.476-201 | ENST00000384347 | 108 nt | BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| NAE1 | Q13564 | Y_RNA.547-201 | ENST00000384654 | 119 nt | BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| NAE1 | Q13564 | MIR548O-201 | ENST00000408583 | 114 nt | BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC108667.1-201 | ENST00000428618 | 249 nt | BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC095059.1-201 | ENST00000502570 | 349 nt | TSL 5 BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU6-947P-201 | ENST00000516264 | 106 nt | BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU7-25P-201 | ENST00000516544 | 62 nt | BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| NAE1 | Q13564 | MIR4744-201 | ENST00000581563 | 82 nt | BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| NAE1 | Q13564 | TRAJ36-201 | ENST00000614481 | 58 nt | APPRIS P1 BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC141273.2-201 | ENST00000618989 | 130 nt | BASIC | 1.31 | □□□□□ -2.2 | | |
| NAE1 | Q13564 | TDRD15-202 | ENST00000622654 | 5805 nt | APPRIS P1 BASIC | 1.3 | □□□□□ -2.2 | | |
| NAE1 | Q13564 | MIR411-201 | ENST00000362239 | 96 nt | BASIC | 1.3 | □□□□□ -2.2 | | |
| NAE1 | Q13564 | Y_RNA.7-201 | ENST00000362352 | 102 nt | BASIC | 1.3 | □□□□□ -2.2 | | |
| NAE1 | Q13564 | SNORD45.3-201 | ENST00000363836 | 72 nt | BASIC | 1.3 | □□□□□ -2.2 | | |
| NAE1 | Q13564 | Y_RNA.238-201 | ENST00000364441 | 102 nt | BASIC | 1.3 | □□□□□ -2.2 | | |