Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NAE1Q13564 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NAE1Q13564 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NAE1Q13564 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NAE1Q13564 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NAE1Q13564 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NAE1Q13564 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
NAE1Q13564 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NAE1Q13564 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NAE1Q13564 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NAE1Q13564 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NAE1Q13564 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NAE1Q13564 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NAE1Q13564 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NAE1Q13564 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
NAE1Q13564 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NAE1Q13564 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NAE1Q13564 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NAE1Q13564 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NAE1Q13564 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
NAE1Q13564 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
NAE1Q13564 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.37□□□□□ -2.19
NAE1Q13564 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
NAE1Q13564 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
NAE1Q13564 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
NAE1Q13564 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
NAE1Q13564 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
NAE1Q13564 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC1.36□□□□□ -2.19
NAE1Q13564 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NAE1Q13564 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NAE1Q13564 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NAE1Q13564 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NAE1Q13564 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NAE1Q13564 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NAE1Q13564 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NAE1Q13564 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NAE1Q13564 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NAE1Q13564 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NAE1Q13564 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NAE1Q13564 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NAE1Q13564 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NAE1Q13564 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NAE1Q13564 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NAE1Q13564 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NAE1Q13564 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
NAE1Q13564 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NAE1Q13564 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
NAE1Q13564 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NAE1Q13564 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NAE1Q13564 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NAE1Q13564 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NAE1Q13564 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NAE1Q13564 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NAE1Q13564 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NAE1Q13564 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NAE1Q13564 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NAE1Q13564 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NAE1Q13564 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NAE1Q13564 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NAE1Q13564 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
NAE1Q13564 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
NAE1Q13564 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NAE1Q13564 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NAE1Q13564 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NAE1Q13564 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
NAE1Q13564 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NAE1Q13564 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NAE1Q13564 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
NAE1Q13564 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NAE1Q13564 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NAE1Q13564 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
NAE1Q13564 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NAE1Q13564 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NAE1Q13564 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NAE1Q13564 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NAE1Q13564 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NAE1Q13564 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NAE1Q13564 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NAE1Q13564 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NAE1Q13564 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NAE1Q13564 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NAE1Q13564 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NAE1Q13564 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
NAE1Q13564 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NAE1Q13564 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NAE1Q13564 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NAE1Q13564 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NAE1Q13564 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NAE1Q13564 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NAE1Q13564 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
NAE1Q13564 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NAE1Q13564 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NAE1Q13564 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NAE1Q13564 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.31□□□□□ -2.2
NAE1Q13564 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NAE1Q13564 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.3□□□□□ -2.2
NAE1Q13564 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NAE1Q13564 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NAE1Q13564 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NAE1Q13564 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.9 ms