Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.01
SMAD4Q13485 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
SMAD4Q13485 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
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