Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RESTQ13127 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RESTQ13127 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RESTQ13127 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RESTQ13127 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RESTQ13127 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RESTQ13127 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RESTQ13127 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RESTQ13127 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RESTQ13127 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
RESTQ13127 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
RESTQ13127 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RESTQ13127 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RESTQ13127 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RESTQ13127 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RESTQ13127 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RESTQ13127 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RESTQ13127 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RESTQ13127 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RESTQ13127 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RESTQ13127 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RESTQ13127 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RESTQ13127 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RESTQ13127 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RESTQ13127 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RESTQ13127 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RESTQ13127 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RESTQ13127 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RESTQ13127 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RESTQ13127 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RESTQ13127 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
RESTQ13127 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RESTQ13127 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RESTQ13127 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
RESTQ13127 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
RESTQ13127 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RESTQ13127 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RESTQ13127 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RESTQ13127 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RESTQ13127 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RESTQ13127 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RESTQ13127 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RESTQ13127 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RESTQ13127 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RESTQ13127 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RESTQ13127 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RESTQ13127 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RESTQ13127 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RESTQ13127 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RESTQ13127 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RESTQ13127 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RESTQ13127 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RESTQ13127 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
RESTQ13127 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RESTQ13127 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
RESTQ13127 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RESTQ13127 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RESTQ13127 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RESTQ13127 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RESTQ13127 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RESTQ13127 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RESTQ13127 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RESTQ13127 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RESTQ13127 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
RESTQ13127 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RESTQ13127 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RESTQ13127 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
RESTQ13127 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
RESTQ13127 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
RESTQ13127 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
RESTQ13127 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RESTQ13127 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RESTQ13127 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RESTQ13127 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RESTQ13127 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RESTQ13127 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RESTQ13127 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RESTQ13127 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RESTQ13127 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RESTQ13127 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RESTQ13127 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RESTQ13127 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RESTQ13127 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RESTQ13127 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RESTQ13127 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RESTQ13127 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RESTQ13127 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RESTQ13127 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
RESTQ13127 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RESTQ13127 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RESTQ13127 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RESTQ13127 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RESTQ13127 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
RESTQ13127 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RESTQ13127 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RESTQ13127 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RESTQ13127 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RESTQ13127 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RESTQ13127 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RESTQ13127 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 263.3 ms