Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC-1.58□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC-1.58□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC-1.59□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 MTCO3P39-201ENST00000514812 518 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 RNY4P10-201ENST00000365571 96 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 MIRLET7A3-201ENST00000362116 74 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC-1.62□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-1.62□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 MIR509-1-201ENST00000385265 94 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 MIR509-2-201ENST00000390724 91 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC-1.63□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC-1.63□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC-1.63□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC-1.63□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC-1.63□□□□□ -2.67
SMG1Q96Q15 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC-1.63□□□□□ -2.67
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