Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
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ATG4CQ96DT6 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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ATG4CQ96DT6 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ATG4CQ96DT6 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ATG4CQ96DT6 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ATG4CQ96DT6 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ATG4CQ96DT6 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
ATG4CQ96DT6 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
ATG4CQ96DT6 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ATG4CQ96DT6 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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ATG4CQ96DT6 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ATG4CQ96DT6 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
ATG4CQ96DT6 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
ATG4CQ96DT6 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
ATG4CQ96DT6 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ATG4CQ96DT6 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ATG4CQ96DT6 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ATG4CQ96DT6 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ATG4CQ96DT6 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
ATG4CQ96DT6 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ATG4CQ96DT6 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ATG4CQ96DT6 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
ATG4CQ96DT6 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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