Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
R3HDM1Q15032 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
R3HDM1Q15032 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
R3HDM1Q15032 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
R3HDM1Q15032 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
R3HDM1Q15032 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
R3HDM1Q15032 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
R3HDM1Q15032 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
R3HDM1Q15032 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
R3HDM1Q15032 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
R3HDM1Q15032 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
R3HDM1Q15032 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
R3HDM1Q15032 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
R3HDM1Q15032 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
R3HDM1Q15032 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
R3HDM1Q15032 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
R3HDM1Q15032 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
R3HDM1Q15032 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
R3HDM1Q15032 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
R3HDM1Q15032 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
R3HDM1Q15032 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
R3HDM1Q15032 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC2.58□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.58□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.58□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.58□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.58□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC2.58□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC2.58□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC2.58□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC2.58□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.58□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.57□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC2.57□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC2.57□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC2.57□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC2.57□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.57□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.57□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC2.57□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC2.57□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.56□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.56□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.56□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC2.56□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.56□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.56□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.56□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.56□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.56□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC2.56□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.56□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC2.56□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.56□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.55□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC2.55□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC2.55□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.55□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC2.54□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.54□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.54□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.54□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.54□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC2.53□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC2.53□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.53□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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