Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RAB39AQ14964 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RAB39AQ14964 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RAB39AQ14964 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RAB39AQ14964 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RAB39AQ14964 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RAB39AQ14964 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
RAB39AQ14964 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RAB39AQ14964 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
RAB39AQ14964 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RAB39AQ14964 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RAB39AQ14964 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RAB39AQ14964 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RAB39AQ14964 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RAB39AQ14964 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RAB39AQ14964 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RAB39AQ14964 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RAB39AQ14964 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RAB39AQ14964 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RAB39AQ14964 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RAB39AQ14964 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.7 ms