Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
SCARF1Q14162 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SCARF1Q14162 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 188.2 ms