Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ITGA9Q13797 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ITGA9Q13797 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ITGA9Q13797 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ITGA9Q13797 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ITGA9Q13797 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ITGA9Q13797 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ITGA9Q13797 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ITGA9Q13797 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ITGA9Q13797 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ITGA9Q13797 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ITGA9Q13797 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ITGA9Q13797 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ITGA9Q13797 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ITGA9Q13797 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ITGA9Q13797 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ITGA9Q13797 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ITGA9Q13797 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ITGA9Q13797 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ITGA9Q13797 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ITGA9Q13797 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
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ITGA9Q13797 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ITGA9Q13797 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ITGA9Q13797 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ITGA9Q13797 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ITGA9Q13797 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ITGA9Q13797 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ITGA9Q13797 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ITGA9Q13797 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ITGA9Q13797 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ITGA9Q13797 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ITGA9Q13797 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ITGA9Q13797 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ITGA9Q13797 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ITGA9Q13797 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ITGA9Q13797 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ITGA9Q13797 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ITGA9Q13797 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ITGA9Q13797 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ITGA9Q13797 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ITGA9Q13797 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ITGA9Q13797 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ITGA9Q13797 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ITGA9Q13797 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ITGA9Q13797 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ITGA9Q13797 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ITGA9Q13797 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ITGA9Q13797 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
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ITGA9Q13797 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
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ITGA9Q13797 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
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ITGA9Q13797 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
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ITGA9Q13797 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
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ITGA9Q13797 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
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ITGA9Q13797 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ITGA9Q13797 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
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