Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PEX6Q13608 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PEX6Q13608 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
PEX6Q13608 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PEX6Q13608 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PEX6Q13608 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PEX6Q13608 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PEX6Q13608 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PEX6Q13608 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PEX6Q13608 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PEX6Q13608 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PEX6Q13608 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PEX6Q13608 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PEX6Q13608 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PEX6Q13608 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PEX6Q13608 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
PEX6Q13608 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PEX6Q13608 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PEX6Q13608 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PEX6Q13608 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PEX6Q13608 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PEX6Q13608 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PEX6Q13608 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
PEX6Q13608 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
PEX6Q13608 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
PEX6Q13608 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
PEX6Q13608 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PEX6Q13608 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PEX6Q13608 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PEX6Q13608 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PEX6Q13608 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
PEX6Q13608 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PEX6Q13608 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PEX6Q13608 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PEX6Q13608 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PEX6Q13608 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PEX6Q13608 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PEX6Q13608 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PEX6Q13608 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PEX6Q13608 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PEX6Q13608 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PEX6Q13608 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PEX6Q13608 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PEX6Q13608 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PEX6Q13608 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
PEX6Q13608 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PEX6Q13608 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PEX6Q13608 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PEX6Q13608 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PEX6Q13608 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
PEX6Q13608 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PEX6Q13608 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PEX6Q13608 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PEX6Q13608 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PEX6Q13608 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
PEX6Q13608 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.18
PEX6Q13608 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PEX6Q13608 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PEX6Q13608 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PEX6Q13608 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PEX6Q13608 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PEX6Q13608 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PEX6Q13608 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
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PEX6Q13608 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PEX6Q13608 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PEX6Q13608 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
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PEX6Q13608 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PEX6Q13608 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PEX6Q13608 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
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PEX6Q13608 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PEX6Q13608 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
PEX6Q13608 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
PEX6Q13608 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
PEX6Q13608 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
PEX6Q13608 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PEX6Q13608 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PEX6Q13608 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PEX6Q13608 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PEX6Q13608 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PEX6Q13608 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PEX6Q13608 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PEX6Q13608 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PEX6Q13608 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PEX6Q13608 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PEX6Q13608 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PEX6Q13608 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PEX6Q13608 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PEX6Q13608 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PEX6Q13608 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PEX6Q13608 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PEX6Q13608 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PEX6Q13608 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PEX6Q13608 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
PEX6Q13608 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
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