Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.1 ms