Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TCIRG1Q13488 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 194.6 ms