Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
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MKRN4PQ13434 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
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MKRN4PQ13434 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
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MKRN4PQ13434 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
MKRN4PQ13434 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
MKRN4PQ13434 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
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MKRN4PQ13434 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
MKRN4PQ13434 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
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MKRN4PQ13434 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
MKRN4PQ13434 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
MKRN4PQ13434 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
MKRN4PQ13434 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
MKRN4PQ13434 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
MKRN4PQ13434 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
MKRN4PQ13434 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
MKRN4PQ13434 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
MKRN4PQ13434 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
MKRN4PQ13434 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
MKRN4PQ13434 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
MKRN4PQ13434 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
MKRN4PQ13434 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
MKRN4PQ13434 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
MKRN4PQ13434 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
MKRN4PQ13434 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
MKRN4PQ13434 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
MKRN4PQ13434 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
MKRN4PQ13434 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
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