Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SNTA1Q13424 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SNTA1Q13424 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SNTA1Q13424 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SNTA1Q13424 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SNTA1Q13424 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SNTA1Q13424 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SNTA1Q13424 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SNTA1Q13424 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SNTA1Q13424 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SNTA1Q13424 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SNTA1Q13424 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SNTA1Q13424 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SNTA1Q13424 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SNTA1Q13424 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SNTA1Q13424 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SNTA1Q13424 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
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