Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ITGB3BPQ13352 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ITGB3BPQ13352 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ITGB3BPQ13352 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ITGB3BPQ13352 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ITGB3BPQ13352 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
ITGB3BPQ13352 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
ITGB3BPQ13352 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ITGB3BPQ13352 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ITGB3BPQ13352 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ITGB3BPQ13352 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ITGB3BPQ13352 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ITGB3BPQ13352 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ITGB3BPQ13352 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ITGB3BPQ13352 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ITGB3BPQ13352 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ITGB3BPQ13352 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
ITGB3BPQ13352 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ITGB3BPQ13352 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ITGB3BPQ13352 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ITGB3BPQ13352 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ITGB3BPQ13352 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ITGB3BPQ13352 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ITGB3BPQ13352 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ITGB3BPQ13352 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ITGB3BPQ13352 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ITGB3BPQ13352 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ITGB3BPQ13352 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ITGB3BPQ13352 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ITGB3BPQ13352 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ITGB3BPQ13352 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ITGB3BPQ13352 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ITGB3BPQ13352 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ITGB3BPQ13352 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ITGB3BPQ13352 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ITGB3BPQ13352 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ITGB3BPQ13352 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ITGB3BPQ13352 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ITGB3BPQ13352 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ITGB3BPQ13352 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ITGB3BPQ13352 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ITGB3BPQ13352 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
ITGB3BPQ13352 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
ITGB3BPQ13352 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
ITGB3BPQ13352 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
ITGB3BPQ13352 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
ITGB3BPQ13352 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC-0.91□□□□□ -2.56
ITGB3BPQ13352 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC-0.91□□□□□ -2.56
ITGB3BPQ13352 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
ITGB3BPQ13352 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
ITGB3BPQ13352 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
ITGB3BPQ13352 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
ITGB3BPQ13352 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ITGB3BPQ13352 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ITGB3BPQ13352 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ITGB3BPQ13352 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ITGB3BPQ13352 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ITGB3BPQ13352 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC-0.92□□□□□ -2.56
ITGB3BPQ13352 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC-0.92□□□□□ -2.56
ITGB3BPQ13352 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ITGB3BPQ13352 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ITGB3BPQ13352 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ITGB3BPQ13352 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ITGB3BPQ13352 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ITGB3BPQ13352 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ITGB3BPQ13352 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
ITGB3BPQ13352 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.93□□□□□ -2.56
ITGB3BPQ13352 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
ITGB3BPQ13352 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC-0.93□□□□□ -2.56
ITGB3BPQ13352 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC-0.93□□□□□ -2.56
ITGB3BPQ13352 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
ITGB3BPQ13352 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
ITGB3BPQ13352 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ITGB3BPQ13352 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ITGB3BPQ13352 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ITGB3BPQ13352 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ITGB3BPQ13352 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ITGB3BPQ13352 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ITGB3BPQ13352 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ITGB3BPQ13352 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ITGB3BPQ13352 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ITGB3BPQ13352 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ITGB3BPQ13352 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC-0.94□□□□□ -2.56
ITGB3BPQ13352 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ITGB3BPQ13352 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ITGB3BPQ13352 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ITGB3BPQ13352 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ITGB3BPQ13352 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.6 ms