Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
TRIM28Q13263 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
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