Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.75□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GPS1Q13098 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
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