Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.94□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
LMAN2Q12907 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
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