Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRQQ9UMZ3 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 217.7 ms